以下は、K. Hausmann, N. Hülsmann & R. Radekが 「Protistology」（E.Schweizerbart'sche Verlagsbuchhandlung, 2003）の中で提唱している最新の知見に基づく 原生生物の区分です。この本は，K. Hausmann, N. Hülsmannによる「Protozoology」第二版（Thieme Medical Pub., 1996）の 改訂版（第三版）ですが，全面改訂と銘打ってあるように，第二版では「原生動物学」ということで 紅藻類やプラシノ藻を除く緑藻類は扱っていませんでしたが，今回の版ではそれらを含めて「原生生物学」 としての分類体系を紹介しています。（そのため，本のタイトルも Protozoologyから Protistology と 変更されている訳です）
とはいえ，以下のリストでは前版「原生動物学」の影響がまだ強く残っています。 たとえば，繊毛虫類についてはかなり詳しく紹介してありますが，植物系の分類群については非常に 簡単にしか記していない，などです。 その繊毛虫類を見ると，2000年に出た Illustrated Guide to the Protozoa, 2nd ed. とはすでに何ケ所か 違いが生じています・・・。
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Tetramastigota門 Tetramastigota レトルタモナス綱 Retortamonadea ディプロモナス綱 Diplomonadea ランブル鞭毛虫など エンテロモナス目 Enteromonadida ディプロモナス目 Diplomonadida オキシモナス綱 Oxymonadea バラベイサル綱 Parabasalea Trichomonadida, Polymonas, Hypermastigida オキシモナス目 Trichomonadida 超鞭毛虫目 Hypermastigida |
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Discicristata門 Discicristata ミドリムシ亜門 Euglenozoa ミドリムシ上綱 Euglenida キネトプラスト上綱 Euglenida ボド綱 Bodonea トリパノソーマ綱 Tripanosomatidea ミドリムシ上綱 Diplonemida Heterolobosa亜門 Heterolobosa ネグレリア綱 Schizopyrenidea アクラシア綱 Acrasea |
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Hemimastigophora門 Hemimastigophora |
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偽繊毛虫門 Pseudociliata |
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クロミスタ門 Chromista プリムネシウム亜門 Prymnesiomonada クリプトモナス亜門 Cryptomonada 不等毛亜門 Heterokonta Proteomonadea綱 Proteomonadea オパリナ綱 Opalinea 黄色鞭毛虫綱 Chryosomonadea 黄色鞭毛虫目 Chryosomonadida ペディネラ目 Pedinellida 珪質鞭毛虫目 Silicoflagellida 珪藻綱 Bacillariophyceae 異形鞭毛虫（クロロメソン）綱 Heteromonadea 真正眼点藻綱 Eustigmatophyceae ラビリンチュラ綱 Labyrinthulea ラフィド藻綱 Raphidomonadea ビコソエカ綱 Bicosoecidea サカゲツボカビ綱 Hyphochytriomycetes 卵菌綱 Oomycetes |
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アルベオラータ門 Alveolata 渦鞭毛虫亜門 Dinoflagellata Diniferea綱 Diniferea Syndinea綱 Syndinea ペルキンスス亜門 Perkinsozoa Colpodellidae科 Colpodellidae アピコンプレクサ亜門 Apicomplexa グレガリナ綱 Gregarinea コクシジウム綱 Coccidea リチドキスチス目 Agamococcida 原コクシジウム目 Protococcida アデレア目 Adeleida アイメリア目 Eimeriida Haematozoea綱 Haematozoea Haemosporida目 Haemosporida ピロプラズマ（バベシア）目 Piroplasmida 繊毛虫亜門 Ciliophora ポストキリオデスマトフォラ上綱 Postciliodesmatophora 原始大核綱 Karyorelictea 原口目（トラケロネマ目） Protostomatida ロクソデス目 Loxodida 原始異毛目 Protoheterotrichida 異毛綱 Heterotrichea リクノフォラ目 Licnophorida 異毛目（ラッパムシ目） Heterotrichida Intramacronucleata上綱 Intramacronucleata 旋毛綱 Spirotrichea プロトクルジア亜綱 Protocruziidia ファコディニウム亜綱 Phacodiniidia 下毛亜綱 Hypotrichia 少毛亜綱 Oligotrichia コレオトリカ亜綱 Choreotrichia 棘毛亜綱 Stichotrichia リトストマ綱 Litostomatea 毒胞亜綱 Haptoria 毛口亜綱 Trichostomatia 層状咽頭綱 Phyllopharyngea 層状咽頭亜綱 Phyllopharyngia 有吻亜綱（アンキストロコマ亜鋼） Rhynchodia 漏斗亜綱 Chonotrichia 吸管虫亜綱 Suctoria 梁口綱 Nasophorea 単膜目（合膜目，ナスロプシス目） Synhymeniida ナスラ目 Nassulida ミクロトラクス目 Microthoracida コルポダ綱 Colpodea 前口綱 Prostomatea プラギオピラ綱 Plagiopylea 貧膜口綱 Oligohymenophorea ゾウリムシ亜綱 Peniculia 有スクチカ亜綱（アンキスツルム亜鋼） Scuticociliatia 膜口亜綱（ミズケムシ亜鋼） Hymenostomatia 隔口亜綱 Apostomatia 周毛亜綱（縁毛亜鋼） Peritrichia 固着目（ツリガネムシ目） Sessilida 遊泳目（レイオトロカ目） Mobilida 無口亜綱 Astomatia クリーブランデラ目 Clevelandellida 歯口目（櫛口目，ディスコモルファ目） Odontostomatida Haplospora亜門 Haplospora |
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ケルコモナス門 Cercozoa Phytomyxa亜門 Phytomyxa Reticulofilosa亜門 Reticulofilosa Monadofilosa亜門 Monadofilosa |
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有孔虫門 Foraminifera |
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Biliphyta門 Biliphyta 紅藻亜門 Rhodophyta 灰色植物亜門 Glaucocystophyta |
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緑色植物門 Viridiplantae 緑藻植物亜門 Chlorophyta Prasinomonads アオサ藻綱 Ulvophyceae トレボウクシア綱 Trebouxiophyceae 緑藻綱 Chlorophyceae ボルボックス目 Volvocida クロロコックム目 Chlorococcales Streptophyta亜門 Streptophyta Mesostigmatophyceae綱 Mesostigmatophyceae Chlorokybophyceae綱 Chlorokybophyceae クレブソルミジウム綱 Klebsormidiophyceae 接合藻綱 Conjugatophyceae |
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アメーバ門 Amoebozoa 葉状根足虫亜門 Lobosa 裸性葉状根足虫綱 Gymnamoebea 無子実体綱 Acarpomyxea 殻性葉状根足虫綱 Testacealobosea Conosa亜門 Conosa Archamoeba下門 Archamoeba 動菌下門 Mycetozoa Eumyxa上綱 Eumyxa プロトステリウム綱 Protostelea ホコリカビ綱 Myxogastrea タマホコリカビ上綱 Dictyostela Achonchlina上綱 Achonchulina |
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Opisthokonta門 Opisthokonta 菌類亜門 Fungi ツボカビ下門 Chytridiomycota 接合菌下門 Zygomycota 真菌下門 Eumycota 微胞子虫上綱 Microspora 微胞子虫綱 Microsporea 子嚢菌上綱 Ascomycota 古生子嚢菌綱 Archaeascomycota 半子嚢菌綱 Hemiascomycota 真正子嚢菌綱 Euascomycota Nephridiophagidae科 Nephridiophagidae 担子菌上綱 Basidiomycota Deuteromycetes 襟鞭毛虫亜門 Choanozoa Mesomycetozoa上綱 Mesomycetozoa 襟鞭毛虫上綱 Chaonoflagellata 中生動物下門 Metazoa 粘液胞子虫上綱 Myxozoa |
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Eukaryota incertae sedis 有軸仮足虫類 Actinopoda 棘針類 Acantharea 多泡類 Polycystinea 濃彩類 Phaeodarea 太陽虫類 Heliozoea タイヨウチュウ類 Actinophryida 有殻太陽虫類 Desmothoracida キリオフリス類 Ciliophryida スチコロンケ類 Taxopodida 内質太陽虫類（有中心粒類；カラタイヨウチュウ類） Centrohelida Paramyxea類 Paramyxea |
References