鞭毛（flagellum, flagella）よりやや細く、細胞表面に多数存在する。 ゾウリムシ（Paramecium caudatum）では、約10μｍの長さのものが10,000〜14,000 本も存在する。 繊毛は一般に規則正しく配列している。 繊毛虫下毛類（ 棘毛類＆ 下毛類）にみられる棘毛（cirrus）は、複数の繊毛が束になったもので 囲口部の運動や、歩行運動などの機能を持つ。
