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| 原生生物界
| 鞭毛虫
＝真正鞭毛虫 Zoomastigina色素体をもたない鞭毛虫。一般に柔軟で小形の細胞が多い。いくつかの群ではアメーバ期が存在する。 有性生殖はごくわずかの群で知られている。１個の核をもつが、その他、 副基体（parabasal body）や キネトプラスト（kinetoplast）、 波動膜（undulating membrane）をもつものもいる。 寄生性のものが多いが、一部は自由生活を営む。
真正鞭毛虫門 Zoomastigina
（「五つの王国」）
ただし、これには アメーボフラゲラ綱（amoeboflagellates）、 オパリナ綱（opalinids）、 襟鞭毛虫綱（choanoflagellates）、 ビコソエス綱（bicosoecids）、 キネトプラスト綱（kinetoplastids）、 ディプロモナス（diplomonads）、 ピルソニンパ綱（pyrsonymphids）、 パラベイサル綱（parabasalids） を含める。
有毛根足虫門（肉質鞭毛虫門） Sarcomastigophora Honigberg & Balamuth, 1963
鞭毛虫亜門 Mastigophora Diesing, 1866
動物性鞭毛虫綱 Zoomastigophora Calkins, 1909
（「An Illustrated Guide to the Protozoa」；「生物学辞典」；「原生動物図鑑」）
Subdivisions
この色の部分
は Hausmann & Hülsmann (1996)で提案されている区分を示している。
目（Order）の部分は従来、その上位の動物性鞭毛虫が綱（Class）として
扱われていたことによる。しかし、Hausmann & Hülsmannは、動物性鞭毛虫をいくつかの門（Phylum）
に分けたことにより、それまで目だったものの多くが綱（または門か亜門）に格上げされた。
Mastigota界
Dimastigota亜界
| Tetramastigota上門 ミトコンドリアをもたない | |||
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レトルタモナス門 Retortamonada |
ハラヒゲムシ目
Retortamonadida レトルタモナス綱 |
Retortamonadidae科 | Chilomastix, Retortamonas (ハラヒゲムシ) |
| Cochlosomidae科 | Cochlosoma | ||
| Basal Eukaryotes ヒゲハラムシ目 Diplomonadida ディプロモナス綱 |
Enteromonadidae科 | Enteromonas | |
| Hexamitidae科 | Trepomonas, Hexamita, Octomitus, Giardia (ランブル鞭毛虫、ヤツヒゲハラムシ) | ||
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Axostylata門
Axostyle=軸桿
|
ピルソニンパ目
Pyrsonymphids オキシモナス綱 Oxymonadea |
Polymastigidae科 | Monocercomonoides, Polymastix |
| Pyrsonymphidae科 | Pyrsonympha, Streblomastix, Dinenympha (?) | ||
| Oxymonas科 | Oxymonas, Sauromonas, Saccinobaculus, Notila, Barroella, Microrhopalodina | ||
| Basal Eukaryotes
パラベイサル綱
ホネマクムシ目 （トリコモナス） Trichomonadida |
Monoceromonadidae科 | Monocercomonas, Tricercomitus, Histomonas, Dientamoeba, Hexamastix, Chilomitus, Hypotrichomonas | |
| トリコモナス科 Trichomonadidae |
Trichomonas (ハトホネマクムシ；トリコモナス), Trichomitus, Tetratrichomonas, Pentatrichomomas, Tritrichomonas, Trichomitopsis, Pseudotrypanosoma, Pentatrihomonoides | ||
| Devescovinidae科 | Devescovina, Foaina, Gigantomonas | ||
| Calonymphidae科 | Kirbynia, Coronympha, Metacoronympha, Calonympha, Stephanonympha, Snyderella (?) | ||
| Basal Eukaryotes
パラベイサル綱
ケカムリ目 （超鞭毛虫） Hypermastigida |
Joeniidae科 | Joenia, Joenopsis, Joenoides, Neotermes | |
| Lophomonadidae科 | Lophomonas | ||
| Rhizonymphidae科 | Rhyzonympha | ||
| Hoplonymphidae科 | Balbulanympha, Rhynchonympha, Urinympha, Hoplonympha | ||
| Staurojoeninidae科 | Staurojoenina | ||
| Trichonymphidae科 | Trichonympha (ケカムリ；トリコニンファ) Koruga, Deltotrichonympha | ||
| Eucomonymphidae科 | Eucomonympha | ||
| Tetratonymphidae科 | Teratonympha (ナガケカムリ) | ||
| Spirotrichosomidae科 | Spirotrichosoma, Macrospironympha, Leptospironympha | ||
| Spirotrichonymphidae科 | Spirotrichonympha | ||
| Holomastigotoididae科 | Holomastigotoides, Spirotrichonymphella | ||
| Metakaryota上門 ミトコンドリアをもつ | |||
| Basal Eukaryotes
ミドリムシ門 |
キネトプラスト目 （マクムシ） Kinetoplastida キネトプラスト亜門 Kinetoplasta |
ボド科 Bodonidae |
Bodo (ボドヒゲムシ), Rhynchomomas, Ichtyobodo, Cryptobia (=Trypanoplasma), Procryptobia, Cephalothamnium, Dimastigella |
| トリパノソーマ科 Trypanosomatidae |
Leptomonas, Herpetomonas, Phytomonas, Blastocrithidia, Rhynchoidomomas, Endotrypanum, Crithidia, Leishmania, Trypanosoma (ネズミマクムシ；トリパノゾーマ), Cercobodo | ||
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不等毛（植物）亜門 Heterokonta |
プロテロモナス目（綱） Proteromonadida / Proteromonadea |
Proteromonas | |
| ビコソエス目 Bicosoecida |
|||
| 襟鞭毛虫目
（エリヒゲムシ） Choanoflagellida 襟鞭毛虫門 Choanoflagellata |
Codonosigidae科 | Monosiga, Codosiga, Codonocladium, Desmarella, Astrosiga, Sphaeroeca, Proterospongia | |
| Salpingoecidae科 | Chanoeca, Salpingoeca (カラエリヒゲムシ), Pachysoeca, Diploeca | ||
| Acanthoecidae科 | Calliacantha, Diaphanoeca, Crinolina, Acanthoeca, Acanthoecopsis, Savillea, Diplotheca, Parvicorbicula, Pleurasiga, Stephanoeca, Saepicula | ||
| Incertae Sedis | |||
| ケルコモナス目 Cercomonadida |
Cercomonas, Heteromita | ||
| マスチゲラ目 Rhizomastigida |
Mastigamoeba, Mastigella | ||
| エブリア目 Ebriida |
Ebria, Hermesinella, Hermesinum | ||
References