内外二重の膜からなり呼吸の場である。 分解された栄養分がピルビン酸となって取り込まれ、TCA回路・電子伝達系を経てエネルギーが取り出される。 植物にはミトコンドリアの他に光合成を行なう葉緑体がある。 リソソームは細胞内で不用になったものを分解する加水分解酵素を含む。