遺伝子組替えを行なわせるためには,制限酵素で切断したDNAどうしを結合させる必要がある。そのために以下の手順で反応を行なわせる。
目的とする二種のDNA 8
DNAリガーゼ 適量
10x反応液 1
10xATP 1
このまま,12゚Cで12〜18時間反応を行なわせる。そのためには,ゾウリムシのストック用に10゚Cにしてあるストッカーに入れておく。